Katedra Pediatrii Klinicznej została powołana na Wydziale Nauk Medycznych Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego w Olsztynie Zarządzeniem Rektora UWM na podstawie Uchwały Senatu z dnia 17 czerwca 2011 roku.
W latach 2011-2013 obowiązki kierownika Katedry Pediatrii Klinicznej pełniła dr n. med. Wanda Badowska.
1 października 2013 roku kierownikiem Katedry Pediatrii Klinicznej została dr hab. n. med. Elżbieta Jarocka-Cyrta, prof. UWM.
Katedra Pediatrii Klinicznej działalność dydaktyczna i naukową prowadzi na terenie Wojewódzkiego Specjalistycznego Szpitala Dziecięcego w Olsztynie, którego dyrektorem jest dr n.med. Krystyna Piskorz -Ogórek